克洛泽的云达不莱梅时期

2003/04赛季结束后，克洛泽为了拯救濒临破产的母队凯泽斯劳滕足球俱乐部，转会至德甲劲旅云达不莱梅队。2005/06赛季，克洛泽是德甲乃至欧洲赛场最令人生畏的锋线杀手。克洛泽在德甲联赛仅出场26次就攻入了25粒进球，并且还有14次助攻，一举夺下德甲金靴和助攻王双料殊荣。各项赛事出场56场打进40球助攻24次，2005/06赛季亦是克洛泽俱乐部生涯中期的颠峰赛季。同年以最高得票率当选德甲最佳球员。
2007年夏天，克洛泽告别云达不莱梅以剩一年合同1500万欧元的身价和800万欧元的顶薪合同，转会至德甲豪门拜仁慕尼黑，创造了当时德甲自成立以来内部转会费最高纪录。克洛泽为云达不莱梅效力的三个赛季中，89次的联赛出场打进53粒进球并有39次助攻，在当时偏重防守的足坛环境以场均效率超过1的恐怖数据，率领云达不莱梅队连续三个赛季打入欧洲冠军联赛正赛并且全部成功打入淘汰赛，创造了球队欧战新历史。